Добрый день!
На самом деле Default Appearance работает по такому принципу:
1. Выделяете элемент или группу элементов
2. Вызываете через контекстное меню настройку внешнего вида по умолчанию
3. Задаете необходимые цветовые и т.п. настройки
Применяется результат данной настройки только на выбранные элементы, а также все, допустим, линки на них на других диаграммах. Суть в том, что мы не выполняем глобального переназначение цвета, границ, шрифтов и т.п., допустим, у UC. Мы только лишь говорим EA, что применять изменения по цветам нужно не для конкретного объекта на данной диаграмме (как это делается через Format Bar на любой диаграмме), а для всех ссылочных копий или экземпляров исходного объекта на всех диаграммах, где он используется.
Прочтите хотя бы Tip, возникающий при наведении на кнопку редактирования Default Appearance. Кроме того, в справке 12.x версии сказано: "... you can change the default appearance for a specific element on all diagrams on which it is found, using the Default Appearance dialog".
Как вариант, можно оперативно набросать скрипток, который будет осуществлять замену по заданному цвету, шрифту и т.п. внешний вид указанных типов элементов (UC, Class, Object и все, что угодно).